More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2437 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  100 
 
 
629 aa  1241    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  41.39 
 
 
615 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  41.31 
 
 
590 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  39.39 
 
 
475 aa  283  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  39.18 
 
 
461 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  39.18 
 
 
461 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6569  Cl- channel, voltage gated  47.49 
 
 
420 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458011  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.74 
 
 
587 aa  243  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  36.81 
 
 
626 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  34.07 
 
 
615 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.63 
 
 
582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  35.45 
 
 
584 aa  234  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  35.39 
 
 
600 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  32.36 
 
 
597 aa  224  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.57 
 
 
608 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  29.25 
 
 
613 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  34.04 
 
 
669 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  31.24 
 
 
603 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  32.85 
 
 
606 aa  203  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  31.43 
 
 
604 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.14 
 
 
613 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.92 
 
 
569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  30.18 
 
 
606 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.43 
 
 
598 aa  198  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  32.72 
 
 
605 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  32.18 
 
 
605 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  30.85 
 
 
603 aa  191  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  31.82 
 
 
605 aa  190  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  33.27 
 
 
605 aa  190  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.3 
 
 
577 aa  188  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.34 
 
 
595 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  32.29 
 
 
595 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.09 
 
 
614 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  31.08 
 
 
631 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  31.07 
 
 
593 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  36.43 
 
 
595 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.43 
 
 
595 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  30.79 
 
 
600 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  34.14 
 
 
595 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  36.43 
 
 
595 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  32.61 
 
 
584 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  29.23 
 
 
640 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  33.8 
 
 
595 aa  181  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  28.98 
 
 
633 aa  180  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  34.79 
 
 
599 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  32.28 
 
 
627 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  27.05 
 
 
585 aa  176  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  32.08 
 
 
595 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  32.61 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  35.84 
 
 
623 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  35.84 
 
 
634 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  35.84 
 
 
634 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  35.84 
 
 
634 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  35.84 
 
 
634 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  35.84 
 
 
623 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.93 
 
 
575 aa  173  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  31.63 
 
 
637 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.83 
 
 
594 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.02 
 
 
602 aa  170  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.22 
 
 
591 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  31.25 
 
 
462 aa  167  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  34.77 
 
 
625 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.22 
 
 
617 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  32.12 
 
 
596 aa  165  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.47 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.75 
 
 
579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.75 
 
 
579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.75 
 
 
579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.75 
 
 
636 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.93 
 
 
863 aa  162  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  28.55 
 
 
590 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.6 
 
 
754 aa  161  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.06 
 
 
591 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  34.59 
 
 
618 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.84 
 
 
628 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.14 
 
 
598 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.2 
 
 
620 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.54 
 
 
589 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.16 
 
 
603 aa  157  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  35.68 
 
 
456 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  31.92 
 
 
533 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.82 
 
 
580 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  31.89 
 
 
634 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  28.55 
 
 
579 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  30.5 
 
 
651 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  28.37 
 
 
590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.67 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.73 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  28.62 
 
 
624 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.14 
 
 
589 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.67 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.14 
 
 
589 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  32.88 
 
 
605 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3124  Cl- channel, voltage gated  28.73 
 
 
596 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  24.73 
 
 
598 aa  148  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.48 
 
 
591 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.14 
 
 
589 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  30.65 
 
 
457 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  29.44 
 
 
627 aa  147  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>