More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2428 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  100 
 
 
637 aa  1291    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  46.09 
 
 
667 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  36.09 
 
 
629 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  35.93 
 
 
647 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  40.44 
 
 
645 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  42.23 
 
 
683 aa  280  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  38.26 
 
 
660 aa  279  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  43.72 
 
 
673 aa  273  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  37.53 
 
 
643 aa  273  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29.28 
 
 
635 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  32.1 
 
 
629 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  37.06 
 
 
630 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  40.73 
 
 
679 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  35.42 
 
 
629 aa  267  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  36.72 
 
 
656 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  36.86 
 
 
656 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  39.96 
 
 
665 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  40.44 
 
 
671 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  31.29 
 
 
662 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  43.15 
 
 
695 aa  257  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  33.81 
 
 
615 aa  257  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.53 
 
 
616 aa  257  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  40.25 
 
 
642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  31.45 
 
 
675 aa  252  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  32.28 
 
 
679 aa  250  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  34.83 
 
 
640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  43.28 
 
 
695 aa  243  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  42.69 
 
 
658 aa  243  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  37.56 
 
 
665 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  36.82 
 
 
654 aa  240  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  32.36 
 
 
662 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  38.4 
 
 
684 aa  230  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  32.26 
 
 
632 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  30.01 
 
 
662 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  34.87 
 
 
695 aa  228  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  31.58 
 
 
690 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  29.25 
 
 
652 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  35.69 
 
 
647 aa  223  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  31.06 
 
 
628 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.72 
 
 
634 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  33.41 
 
 
660 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  34.34 
 
 
660 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  35.29 
 
 
651 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  32.44 
 
 
627 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  41.57 
 
 
644 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  32.22 
 
 
621 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  32.52 
 
 
660 aa  213  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  28.95 
 
 
636 aa  213  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  34.91 
 
 
711 aa  210  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  33.51 
 
 
645 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  32.33 
 
 
690 aa  207  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  42.99 
 
 
635 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  31.53 
 
 
660 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  40.99 
 
 
759 aa  205  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  29.65 
 
 
626 aa  203  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  32.44 
 
 
690 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  32.82 
 
 
625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  40.35 
 
 
681 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  38.55 
 
 
647 aa  198  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.61 
 
 
639 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  39.36 
 
 
691 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  34.88 
 
 
657 aa  194  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  31.21 
 
 
777 aa  193  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  35.17 
 
 
657 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  28.79 
 
 
682 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  33.06 
 
 
642 aa  190  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  32.11 
 
 
614 aa  191  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  36.81 
 
 
718 aa  188  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  35.17 
 
 
583 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  30.3 
 
 
675 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.35 
 
 
675 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  33.9 
 
 
658 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  33.6 
 
 
598 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  33.33 
 
 
658 aa  183  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  35.95 
 
 
678 aa  183  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  30.75 
 
 
603 aa  183  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  35.77 
 
 
638 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  35.71 
 
 
716 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  38.62 
 
 
726 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  38.62 
 
 
726 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  38.62 
 
 
726 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  27.35 
 
 
658 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  35.16 
 
 
720 aa  174  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  34.8 
 
 
679 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  31.68 
 
 
604 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  33.72 
 
 
688 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  30.95 
 
 
690 aa  164  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  31.39 
 
 
603 aa  164  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  31.39 
 
 
603 aa  164  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  34.3 
 
 
671 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  32.84 
 
 
675 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  35.51 
 
 
734 aa  160  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  31.92 
 
 
625 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  27.19 
 
 
622 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  26.98 
 
 
696 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  33.17 
 
 
715 aa  158  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  36.57 
 
 
720 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  35.52 
 
 
632 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  35.56 
 
 
685 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  26.09 
 
 
675 aa  153  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>