96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2405 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  50.55 
 
 		 184 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  46.41 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  42.31 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.86 
 
 		 220 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  34.87 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.3 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  34.23 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  31.72 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  35.57 
 
 		 217 aa  87.8  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  36.3 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  36.57 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  34.16 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  31.49 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  33.53 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  33.53 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  33.53 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  32.87 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  28.37 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  30.61 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  30.14 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.12 
 
 		 229 aa  62  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  28.32 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  28.32 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.32 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  27.91 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  27.1 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  27.7 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.58 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.75 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  25.61 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.09 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  26.38 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  31.53 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  26.38 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  26.95 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  26.38 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  24.83 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 		 236 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  26.98 
 
 		 180 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  30 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  24.66 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.9 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  23.24 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  29.82 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 		 184 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  30.19 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  31.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  31.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  31.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  31.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.19 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  27.52 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  27.61 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  31.48 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  27.93 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  26.45 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  24.4 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.9 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  30.22 
 
 		 189 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.57 
 
 		 192 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  29.2 
 
 		 213 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  29.57 
 
 		 205 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  27.46 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  23.48 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  27.88 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>