More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2327 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
591 aa  1183    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  69.3 
 
 
610 aa  782    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4041  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
543 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168889  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 
539 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  34.02 
 
 
564 aa  303  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.83 
 
 
545 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.63 
 
 
540 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  45.43 
 
 
540 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 
561 aa  289  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  45.15 
 
 
537 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0896  sensor histidine kinase/response regulator  42.86 
 
 
551 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406466  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4203  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
520 aa  253  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118856  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1172 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
1174 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
1152 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1145 aa  216  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
744 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
662 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
1146 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  33.16 
 
 
1141 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  38.34 
 
 
633 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
1167 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
589 aa  213  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  34.69 
 
 
1159 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1146 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  34.44 
 
 
1159 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
645 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 
1146 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
655 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  32.89 
 
 
609 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33 
 
 
1169 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  32.5 
 
 
1145 aa  207  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  34.09 
 
 
1161 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  37.2 
 
 
604 aa  207  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1163 aa  207  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
1159 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
1145 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  34.62 
 
 
577 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  35.58 
 
 
594 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1159 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
634 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
635 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1152 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
1140 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  32.25 
 
 
1146 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1146 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1168 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  30.64 
 
 
591 aa  203  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
1171 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1146 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1146 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1140 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1158 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1140 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
1159 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  30.4 
 
 
1142 aa  200  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  33.89 
 
 
1174 aa  200  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1316 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  38.66 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
1156 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
554 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
816 aa  197  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
567 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
1166 aa  196  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  32.18 
 
 
1147 aa  196  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
1159 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  32.07 
 
 
1147 aa  196  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
574 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  34.61 
 
 
1150 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  32.75 
 
 
1157 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
1172 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.7 
 
 
854 aa  193  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  30.96 
 
 
1177 aa  193  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  31.81 
 
 
1055 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  31.78 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  31.99 
 
 
606 aa  191  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  33.84 
 
 
881 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.24 
 
 
1158 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  31.63 
 
 
1148 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  36.67 
 
 
448 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  32.83 
 
 
1169 aa  187  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
1177 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
675 aa  186  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1161 aa  186  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
621 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  36.86 
 
 
663 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  31.05 
 
 
452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  33 
 
 
868 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  36.1 
 
 
777 aa  184  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
663 aa  184  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1116 aa  183  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
854 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
571 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
883 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
880 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 
1138 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  35.31 
 
 
476 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  33.42 
 
 
629 aa  180  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>