More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2265 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.78 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.77 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.98 
 
 		 273 aa  254  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.8 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.51 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.14 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.26 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.14 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.64 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.88 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.15 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.28 
 
 		 273 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.44 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.44 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.92 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.09 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.06 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.4 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.03 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.91 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.36 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.08 
 
 		 272 aa  214  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.48 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.55 
 
 		 271 aa  205  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.75 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.91 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.81 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.79 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.09 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.56 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.96 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.96 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.44 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.28 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.46 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.41 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.7 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.04 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.03 
 
 		 274 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.52 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.9 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  42.93 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.1 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  41.95 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.74 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  39.49 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.74 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 272 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.01 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>