More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2256 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 205 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  67.54 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  62.83 
 
 		 204 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  61.78 
 
 		 202 aa  248  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  63.49 
 
 		 207 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  63.35 
 
 		 207 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  63.68 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  59.71 
 
 		 206 aa  247  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  63.3 
 
 		 198 aa  244  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  59.9 
 
 		 225 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  60.32 
 
 		 239 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  62.43 
 
 		 225 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  61.9 
 
 		 225 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  63.04 
 
 		 196 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  62.77 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  63.3 
 
 		 202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  60.21 
 
 		 201 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  59.02 
 
 		 239 aa  227  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  59.59 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  59.68 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  59.59 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  61.34 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  58.25 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  62.96 
 
 		 203 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  65.08 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  62.63 
 
 		 248 aa  224  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  59.11 
 
 		 248 aa  223  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  62.03 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  57.07 
 
 		 202 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  59.04 
 
 		 189 aa  220  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  58.51 
 
 		 243 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  63.86 
 
 		 235 aa  215  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  57.14 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  57.07 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  54.37 
 
 		 243 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  54.73 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  50.26 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 192 aa  204  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  46.47 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.29 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  44.52 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.54 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  46.43 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  48.54 
 
 		 191 aa  151  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 191 aa  148  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 		 216 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.75 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  44.12 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  37.02 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  42.13 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  46.94 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.71 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  48 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  48 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.44 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  50.33 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58488  normal  0.821965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  42.6 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  42.6 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.06 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  41.48 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  40.23 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  39.66 
 
 		 193 aa  141  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  44.12 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  46.91 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  44.52 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  47.37 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  38.66 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>