19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2239 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2623  putative lipoprotein  27.63 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1585  putative lipoprotein  27.63 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2708  putative lipoprotein  27.63 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1657  putative lipoprotein  24.35 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0929  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.621879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1046  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0938  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1027  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0964  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2466  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00876  hypothetical protein  23.66 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00870  predicted lipoprotein  23.66 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.284686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2731  putative lipoprotein  23.66 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.658274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0969  putative lipoprotein  23.66 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1724  hypothetical protein  25.68 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2777  putative lipoprotein  23.66 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0075332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1025  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 171 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0893  putative lipoprotein  24.69 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>