25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2162 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  65 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  59.41 
 
 		 106 aa  133  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  56.7 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  47.57 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  44.76 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  41.84 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  46.07 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  46.51 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  44.19 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  37.62 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  32.38 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  41.54 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 103 aa  43.5  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 106 aa  43.5  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0600  hypothetical protein  51.22 
 
 		 137 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  28.12 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>