More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2123 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 
166 aa  339  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.33 
 
 
165 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  55.06 
 
 
165 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  55.06 
 
 
165 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  55.21 
 
 
166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  57.24 
 
 
149 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  53.5 
 
 
164 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.85 
 
 
170 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.09 
 
 
172 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  53.9 
 
 
167 aa  168  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.86 
 
 
164 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  52.5 
 
 
170 aa  167  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.9 
 
 
169 aa  167  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  54.55 
 
 
161 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.7 
 
 
172 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.57 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  61.48 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.9 
 
 
168 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  51.32 
 
 
168 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  51.32 
 
 
168 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.77 
 
 
170 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.77 
 
 
170 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.68 
 
 
158 aa  158  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.68 
 
 
174 aa  157  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  65 
 
 
174 aa  157  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2626  peptidoglycan-associated lipoprotein  57.33 
 
 
176 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  52.15 
 
 
170 aa  155  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  51.2 
 
 
167 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2415  OmpA/MotB domain-containing protein  48.81 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  51.22 
 
 
173 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3199  peptidoglycan-associated lipoprotein  57.82 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3170  OmpA/MotB  60.16 
 
 
172 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.45 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0280  peptidoglycan-associated lipoprotein  58.82 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.53 
 
 
185 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3494  peptidoglycan-associated lipoprotein  65.49 
 
 
177 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373664  normal  0.13836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  58.56 
 
 
182 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  58.56 
 
 
182 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  57.66 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1112  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.98 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.248876  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  60.38 
 
 
152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  57.58 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  52.14 
 
 
167 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.85 
 
 
153 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.69 
 
 
172 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.14 
 
 
154 aa  121  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0976  OmpA/MotB  59.09 
 
 
172 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105437  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.4 
 
 
181 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.86 
 
 
241 aa  117  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  46.53 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  57.01 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  45.83 
 
 
193 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.18 
 
 
199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  36.09 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  55.66 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.55 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  49.49 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.27 
 
 
176 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.29 
 
 
153 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  34.71 
 
 
174 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.4 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  48.11 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.48 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.02 
 
 
168 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  39.16 
 
 
172 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.55 
 
 
179 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0752  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.02 
 
 
169 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000800754  normal  0.153168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.02 
 
 
168 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.81 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.4 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  40.4 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.08 
 
 
199 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  40 
 
 
170 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40 
 
 
170 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40 
 
 
170 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  40 
 
 
170 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40 
 
 
170 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  48.6 
 
 
205 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  45.24 
 
 
148 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40 
 
 
170 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40 
 
 
170 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.19 
 
 
200 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.88 
 
 
169 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.88 
 
 
169 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  50 
 
 
177 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.74 
 
 
163 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.78 
 
 
173 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 
178 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.21 
 
 
174 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.21 
 
 
174 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.91 
 
 
163 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  39.38 
 
 
170 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.17 
 
 
188 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.21 
 
 
174 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.06 
 
 
174 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.21 
 
 
174 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 
184 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.98 
 
 
187 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  49.02 
 
 
185 aa  104  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>