167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2065 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  781    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3375  hypothetical protein  54.55 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0248134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39830  hypothetical protein  54.03 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  51.52 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  50.67 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  51.78 
 
 		 377 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0349  PepSY-associated TM helix domain protein  51.64 
 
 		 370 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0817  PepSY-associated TM helix domain protein  52.47 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  51.21 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0377  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  50.94 
 
 		 370 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1123  PepSY-associated TM helix domain protein  51.18 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5190  PepSY-associated TM helix  50.13 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  51.78 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1737  hypothetical protein  53.02 
 
 		 380 aa  342  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2069  PepSY-associated TM helix domain protein  50.52 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  48.9 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3008  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  50.64 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1877  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  50.53 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2081  PepSY-associated TM helix domain protein  48.47 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1435  PepSY-associated membrane protein  47.67 
 
 		 376 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3271  PepSY-associated TM helix  47.31 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3894  PepSY-associated TM helix domain protein  46.26 
 
 		 371 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7043  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  42.08 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5956  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.22 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52704  decreased coverage  0.00676622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.13 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  24.5 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  24.56 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  24.02 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  24.41 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  22.28 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  25.19 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  25 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  25.19 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  24.62 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  22.52 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  22.14 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  23.27 
 
 		 543 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.85 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  23.65 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.8 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.21 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.25 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.97 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  22.73 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.67 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.53 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.79 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  28.57 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  26.6 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.6 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  21.54 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.62 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.6 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.87 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.24 
 
 		 539 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  24.91 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.32 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  25.32 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  22.28 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.02 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  23.53 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  23.59 
 
 		 521 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  22.16 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.8 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.51 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  21.93 
 
 		 539 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.86 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  23.39 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  23.45 
 
 		 641 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  21.36 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  24.79 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3065  PepSY-associated TM helix  21.6 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.5229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  23.45 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.98 
 
 		 540 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2394  PepSY-associated TM helix  25.06 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  22.77 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1573  PepSY-associated TM helix domain protein  23.26 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0338986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0847  PepSY-associated TM helix  28.52 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.94 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.74 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.35 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0586  membrane protein  21.61 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  23.53 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  24.54 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  20.83 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  22.81 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.56 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  23.63 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.85 
 
 		 525 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  22.89 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.92 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  23.75 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  21.5 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.47 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.91 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  25.1 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  25.1 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  25.1 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  21.37 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>