237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2052 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  63.96 
 
 		 625 aa  778    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  60.14 
 
 		 615 aa  684    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  63.08 
 
 		 620 aa  764    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  64.91 
 
 		 638 aa  760    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  65.88 
 
 		 620 aa  809    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  63.71 
 
 		 616 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  65.99 
 
 		 617 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  65.31 
 
 		 622 aa  781    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  63.93 
 
 		 625 aa  789    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  60.64 
 
 		 606 aa  711    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  63.12 
 
 		 616 aa  753    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  64.69 
 
 		 619 aa  795    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  57.67 
 
 		 597 aa  706    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  65.48 
 
 		 610 aa  787    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  59.76 
 
 		 607 aa  716    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  62.5 
 
 		 626 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  64.63 
 
 		 632 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  63.38 
 
 		 626 aa  787    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  57.85 
 
 		 606 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  64.36 
 
 		 616 aa  775    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  100 
 
 		 614 aa  1257    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  64.13 
 
 		 601 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  63.11 
 
 		 623 aa  757    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  59.29 
 
 		 620 aa  695    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  60.64 
 
 		 606 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  60.64 
 
 		 606 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  58.98 
 
 		 615 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  58.59 
 
 		 611 aa  694    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  64.92 
 
 		 664 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  66.05 
 
 		 620 aa  813    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  64.13 
 
 		 625 aa  778    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  65.82 
 
 		 617 aa  792    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  65.37 
 
 		 627 aa  790    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  65.47 
 
 		 620 aa  813    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  67.01 
 
 		 634 aa  813    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  49.07 
 
 		 608 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  44.46 
 
 		 589 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.94 
 
 		 601 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.33 
 
 		 607 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  41.88 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  41.88 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.63 
 
 		 573 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.44 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  35.38 
 
 		 569 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.59 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  36.55 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.35 
 
 		 591 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  35.43 
 
 		 573 aa  365  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  34.81 
 
 		 573 aa  365  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  38.03 
 
 		 596 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  35.4 
 
 		 573 aa  360  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  34.92 
 
 		 572 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  37.5 
 
 		 601 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  38.66 
 
 		 612 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.5 
 
 		 589 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  36.99 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  35.39 
 
 		 573 aa  341  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  33.93 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.96 
 
 		 603 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  34.84 
 
 		 577 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.76 
 
 		 578 aa  270  8e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.86 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.27 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.33 
 
 		 597 aa  247  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.81 
 
 		 584 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  27.56 
 
 		 619 aa  207  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  29.42 
 
 		 609 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  27.3 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.17 
 
 		 586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  25.08 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  27.11 
 
 		 596 aa  193  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  24.71 
 
 		 598 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.29 
 
 		 593 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  24.68 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.75 
 
 		 582 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  25.29 
 
 		 598 aa  187  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.29 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  26.21 
 
 		 597 aa  177  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.12 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  28.98 
 
 		 600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  27.01 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  26 
 
 		 608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  27.47 
 
 		 600 aa  174  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  25.92 
 
 		 599 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  27.15 
 
 		 618 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  26.17 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  27.15 
 
 		 607 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1902  oligoendopeptidase F  27.2 
 
 		 649 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.92 
 
 		 612 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  27.83 
 
 		 599 aa  169  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  25.67 
 
 		 597 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  30.88 
 
 		 654 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.72 
 
 		 598 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  26.57 
 
 		 594 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.86 
 
 		 603 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0442  oligopeptidase F  26.57 
 
 		 597 aa  166  9e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  26.09 
 
 		 595 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.41 
 
 		 606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  27.06 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  26.07 
 
 		 604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>