More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2005 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  38.5 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.6 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  38.1 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  38.61 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  36.67 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  38.58 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  35.71 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  35.71 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  35 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  35.86 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  37.62 
 
 		 221 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  37.68 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  36.19 
 
 		 221 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  34.55 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  35.92 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.85 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  35.44 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 217 aa  130  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  34.5 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  36 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  36.02 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  36.71 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  36.36 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.35 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.64 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  35.96 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  36.59 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  35.07 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  35.85 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  33.17 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  34 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.16 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  35.38 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.55 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.38 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.38 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  34.65 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  34.7 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  34.5 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  33.01 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  34.5 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.45 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  34.63 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.01 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  32.5 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  34.4 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.11 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  34.88 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  33.98 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  32.39 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  33.5 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  31.19 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  34.93 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  34.27 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  33 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 227 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.55 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  33.99 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  31.63 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.68 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  35.64 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  32.04 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  36.14 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  32.37 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.4 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.4 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  31.79 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.4 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  30.92 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  31 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 232 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  34.45 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  31.34 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  32.42 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  32.29 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  33.99 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  33.99 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>