72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1996 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 310 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  46.79 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  41.05 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  45.33 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 260 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  43.06 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  42.96 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  40.85 
 
 		 229 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  39.04 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  41.27 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  41.27 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 185 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  36.11 
 
 		 226 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 226 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  36.99 
 
 		 185 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  35.38 
 
 		 251 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  39.1 
 
 		 182 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  39.37 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  36.05 
 
 		 190 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  35.82 
 
 		 197 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 		 182 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 268 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  36.64 
 
 		 184 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  35.9 
 
 		 190 aa  90.1  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 222 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 179 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 177 aa  89.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 181 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 		 175 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  36.22 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 187 aa  85.5  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  36.62 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  33.83 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.09 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  30.82 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  34.56 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  37.24 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  36.89 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 171 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  34.41 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  34.67 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  36.88 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.9 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  32.79 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  32.52 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  30.89 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  29.01 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  29.01 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  30.94 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.55 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  25.88 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 168 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  35.11 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  34.25 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  36.26 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 		 140 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 203 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>