47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1991 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  64.04 
 
 
230 aa  311  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  64.63 
 
 
230 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  55.46 
 
 
237 aa  264  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  38.1 
 
 
231 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  39.47 
 
 
237 aa  178  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  42.92 
 
 
236 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  36.4 
 
 
231 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  35.96 
 
 
231 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  36.4 
 
 
231 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  35.53 
 
 
231 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  34.62 
 
 
247 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  34.76 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  36.29 
 
 
249 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  35.02 
 
 
245 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  36.44 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  29.27 
 
 
246 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  35.17 
 
 
239 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  35.59 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  34.45 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  34.04 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  35.17 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  31.84 
 
 
544 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  27.35 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  28.89 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  50 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  25.32 
 
 
338 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  30.49 
 
 
492 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  33.01 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  26.8 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  29.89 
 
 
400 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  26.34 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  30.14 
 
 
396 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  29.71 
 
 
415 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  29.49 
 
 
398 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  29.05 
 
 
393 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  28 
 
 
397 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0040  hypothetical protein  27.27 
 
 
392 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06601  hypothetical protein  26.79 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  26.44 
 
 
402 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  26.44 
 
 
402 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  27.66 
 
 
484 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06601  hypothetical protein  28.57 
 
 
392 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4531  hypothetical protein  30.43 
 
 
271 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889024 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18771  hypothetical protein  29.22 
 
 
407 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>