285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1955 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1955  ATPase  100 
 
 		 315 aa  641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  67.45 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  63.37 
 
 		 315 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  62.95 
 
 		 315 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  62.71 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  62.16 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.57 
 
 		 323 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  58.95 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  55.67 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  57.89 
 
 		 326 aa  331  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  56.2 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.84 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.84 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  53.15 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.1 
 
 		 413 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  48.66 
 
 		 303 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  50.17 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5478  ATPase  52.98 
 
 		 377 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.317231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  53.67 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.15 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1932  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.03 
 
 		 421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.48 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  50.67 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  50.33 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  50.67 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  50.67 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  50.52 
 
 		 301 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  50.17 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.84 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  50 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  50.35 
 
 		 297 aa  275  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.57 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.17 
 
 		 298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.17 
 
 		 298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  49.65 
 
 		 302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.17 
 
 		 299 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  50.18 
 
 		 299 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.15 
 
 		 295 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  47.81 
 
 		 295 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  49.17 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.23 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.15 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  46.49 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.8 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.95 
 
 		 300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47 
 
 		 300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  47.67 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  48.91 
 
 		 284 aa  268  8e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  47.67 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  47.65 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  49.65 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.73 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.15 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  48.32 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  47.3 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  48.3 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  48.64 
 
 		 304 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  46.51 
 
 		 302 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  49.09 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.14 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  47.65 
 
 		 291 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  47.08 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  47.65 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  47.6 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.83 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.03 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  46.28 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  49.28 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  48.3 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  48.42 
 
 		 303 aa  258  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  43.92 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0558  AAA ATPase  46.13 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.847744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  46.83 
 
 		 291 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  48.94 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  47.65 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.04 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.62 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  48.56 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  46.38 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  51.25 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  44.26 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  46.55 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  41.58 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.84 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.49 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  44.08 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  46.37 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  48.35 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  41.67 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.34 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  42.41 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  44.7 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  43.1 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.67 
 
 		 291 aa  241  9e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  44.64 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  45.91 
 
 		 288 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.44 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  43.3 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.86 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.15 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>