More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1921 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
434 aa  882    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.35 
 
 
436 aa  616  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.74 
 
 
438 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  68.28 
 
 
435 aa  608  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.59 
 
 
438 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.05 
 
 
436 aa  596  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.28 
 
 
439 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  67.97 
 
 
436 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  66.59 
 
 
440 aa  589  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  66.28 
 
 
438 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  66.51 
 
 
434 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.28 
 
 
435 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.05 
 
 
436 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  66.28 
 
 
438 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.37 
 
 
437 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  65.82 
 
 
433 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  63.51 
 
 
441 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  65.82 
 
 
434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  66.36 
 
 
463 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  65.59 
 
 
434 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  63.05 
 
 
442 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  64.98 
 
 
439 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  65.36 
 
 
438 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  65.53 
 
 
447 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.52 
 
 
433 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.13 
 
 
436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  63.13 
 
 
434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  62.9 
 
 
434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.82 
 
 
434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  65.82 
 
 
452 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.44 
 
 
438 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  64.06 
 
 
456 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.82 
 
 
433 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.91 
 
 
438 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.92 
 
 
434 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.38 
 
 
437 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.83 
 
 
451 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60 
 
 
434 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60 
 
 
434 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.3 
 
 
434 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.14 
 
 
438 aa  534  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  58.64 
 
 
449 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  60 
 
 
464 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  58.41 
 
 
441 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.22 
 
 
460 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.93 
 
 
478 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.9 
 
 
443 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.39 
 
 
474 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.16 
 
 
474 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.14 
 
 
453 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.99 
 
 
436 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.76 
 
 
440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.99 
 
 
460 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  50.46 
 
 
438 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.55 
 
 
467 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  53.09 
 
 
473 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.92 
 
 
438 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  49.77 
 
 
443 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  49.31 
 
 
437 aa  438  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  49.31 
 
 
437 aa  438  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  50.12 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.72 
 
 
438 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  48.64 
 
 
440 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.72 
 
 
436 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  50.23 
 
 
442 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  49.88 
 
 
446 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  51.49 
 
 
436 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  51.49 
 
 
435 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.45 
 
 
450 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  48.67 
 
 
470 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.28 
 
 
440 aa  425  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.28 
 
 
440 aa  425  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.67 
 
 
470 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  48.97 
 
 
437 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.89 
 
 
450 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  48.34 
 
 
454 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  48.23 
 
 
470 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.1 
 
 
453 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  47.79 
 
 
470 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.79 
 
 
470 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  50 
 
 
445 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  47.89 
 
 
454 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  46.26 
 
 
466 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  48.74 
 
 
437 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.79 
 
 
470 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  47.71 
 
 
435 aa  421  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.25 
 
 
466 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  46.73 
 
 
453 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.58 
 
 
466 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.79 
 
 
470 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  46.95 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.01 
 
 
473 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.18 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  48.01 
 
 
473 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.03 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.01 
 
 
473 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  47.46 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.8 
 
 
457 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  47.73 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  48.03 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>