75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1801 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  78.84 
 
 		 191 aa  302  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  59.12 
 
 		 183 aa  207  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  54.35 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  54.35 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  54.35 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.88 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  33.55 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  33.99 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  28.09 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  31.37 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.37 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  31.37 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  31.55 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  34.56 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  29.45 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  28.82 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  28 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  30.2 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  28.82 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  32.5 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  30.08 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  30.2 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  27.86 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  27.78 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.49 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.93 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  25.34 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  30.4 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  28.42 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  30.06 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.2 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  26.95 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.82 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  28.93 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  27.1 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  27.69 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  29.51 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  22.79 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  25.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  25.69 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.36 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  24.79 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.23 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  25.33 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.25 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  26.9 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  26.39 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.52 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  26.21 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  26.21 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  23.81 
 
 		 859 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  23.94 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  28.65 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  29.56 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  26.24 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  32.11 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>