160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1740 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 460 aa  947    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  49.68 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  48.24 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  46.77 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  43.75 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  48.57 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  44.52 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  42.66 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  38.5 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  39.35 
 
 		 470 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  38.55 
 
 		 437 aa  279  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  36.62 
 
 		 437 aa  279  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  36.78 
 
 		 438 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  37.01 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  39.34 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  36.83 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  38.39 
 
 		 424 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 		 437 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  36.45 
 
 		 437 aa  266  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  37.3 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  35.05 
 
 		 412 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  37.06 
 
 		 437 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  37.06 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  37.06 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  35.15 
 
 		 423 aa  261  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  35.56 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.49 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  35.83 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  35.66 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  36.62 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  38.02 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  38.41 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  36.07 
 
 		 433 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  36.7 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  34.75 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  34.04 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  36.02 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  34.47 
 
 		 473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  34.04 
 
 		 415 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  34.04 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  36.11 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  36.15 
 
 		 427 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  36.43 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  33.41 
 
 		 425 aa  233  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  34.19 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  34.67 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  33.94 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  35.43 
 
 		 445 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  34.33 
 
 		 447 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  32.84 
 
 		 475 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.49 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  30.23 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  28.23 
 
 		 478 aa  159  7e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.15 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.54 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.73 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.77 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  27.29 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.08 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  28.54 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  27.7 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.08 
 
 		 574 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  26.44 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  27.42 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  29.46 
 
 		 572 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.22 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  27.8 
 
 		 556 aa  103  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  31.28 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  25.74 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  25.56 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  24.8 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.47 
 
 		 454 aa  67  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  21.5 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  26.84 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  29.5 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.24 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.34 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.81 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.36 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.52 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  21.2 
 
 		 642 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  28.77 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.08 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  27.22 
 
 		 362 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.22 
 
 		 357 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  28.57 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.71 
 
 		 355 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  25.7 
 
 		 440 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.21 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  29.48 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>