More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1692 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
504 aa  1020    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  42.98 
 
 
476 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  41.25 
 
 
475 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  39.84 
 
 
493 aa  353  5e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 
503 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  41.24 
 
 
496 aa  347  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  41.1 
 
 
503 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  42.55 
 
 
505 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  43.34 
 
 
497 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  37.08 
 
 
513 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  42.5 
 
 
520 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  39.63 
 
 
497 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  41.58 
 
 
488 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  38.67 
 
 
480 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  36.76 
 
 
513 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  36.76 
 
 
482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  41.36 
 
 
497 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  41.52 
 
 
493 aa  316  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 
513 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  37.11 
 
 
516 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  35.64 
 
 
471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  38.3 
 
 
493 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  38.44 
 
 
478 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  38.79 
 
 
514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  38.14 
 
 
487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  38.34 
 
 
500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  38.9 
 
 
479 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  38.57 
 
 
524 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  37.16 
 
 
494 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  33.78 
 
 
513 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  35.19 
 
 
479 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  35.26 
 
 
479 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 
478 aa  242  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  36.4 
 
 
490 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  32.45 
 
 
489 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  38.9 
 
 
492 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 
489 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  32.76 
 
 
493 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  32.28 
 
 
489 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 
489 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.06 
 
 
479 aa  197  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.92 
 
 
494 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  35.66 
 
 
445 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  42.44 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  38.17 
 
 
424 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  32.87 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 
453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  34.07 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  39.68 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  39.73 
 
 
289 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  42.33 
 
 
445 aa  131  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  35.24 
 
 
447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  36 
 
 
432 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  32.18 
 
 
265 aa  128  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  34.51 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 
247 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.39 
 
 
424 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  32.62 
 
 
443 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  35.38 
 
 
262 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 
275 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  36.1 
 
 
259 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  34.55 
 
 
263 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  32.67 
 
 
278 aa  116  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  37.92 
 
 
289 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 
292 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 
266 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  38.1 
 
 
289 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 
266 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.41 
 
 
264 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  32.66 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  34.75 
 
 
266 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  34.55 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  33.67 
 
 
292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 
279 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 
279 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.85 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
272 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  33.96 
 
 
280 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  29.27 
 
 
269 aa  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  29.34 
 
 
268 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  32.93 
 
 
284 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  32.27 
 
 
269 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.67 
 
 
278 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.53 
 
 
248 aa  108  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  33.47 
 
 
262 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  32.32 
 
 
269 aa  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  33.48 
 
 
285 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 
268 aa  106  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  30.13 
 
 
566 aa  106  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  30.58 
 
 
473 aa  106  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  33.02 
 
 
267 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  35.91 
 
 
265 aa  106  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 
320 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  33.64 
 
 
312 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  35.23 
 
 
392 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35 
 
 
572 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  35 
 
 
572 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 
271 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>