38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1680 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1575    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  28.61 
 
 		 591 aa  94.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  29.84 
 
 		 708 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.15 
 
 		 681 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  31.34 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  32.97 
 
 		 654 aa  80.1  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  27.01 
 
 		 676 aa  78.6  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  25.3 
 
 		 697 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  29.78 
 
 		 654 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  24.3 
 
 		 670 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  33.97 
 
 		 494 aa  67  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  26.4 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.51 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.29 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.46 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.49 
 
 		 672 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.56 
 
 		 666 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  26.4 
 
 		 564 aa  52  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.91 
 
 		 626 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.7 
 
 		 603 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25 
 
 		 712 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.63 
 
 		 616 aa  48.5  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.23 
 
 		 591 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.39 
 
 		 615 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.73 
 
 		 613 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  27.61 
 
 		 623 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  31.07 
 
 		 427 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.87 
 
 		 642 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  22.55 
 
 		 588 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  25 
 
 		 606 aa  45.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.56 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.03 
 
 		 589 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.76 
 
 		 603 aa  44.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  43.18 
 
 		 1194 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  37.31 
 
 		 374 aa  44.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.04 
 
 		 608 aa  44.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.58 
 
 		 595 aa  44.3  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  23.19 
 
 		 703 aa  43.9  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>