125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1659 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  46.2 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  44.19 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  45.56 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  38.69 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  35.5 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  33.14 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  37.67 
 
 		 194 aa  95.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  33.93 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  28.25 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.28 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25.93 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  31.78 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.66 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  26.39 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  31.01 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  23.78 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.5 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.45 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  27.52 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  30.88 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.19 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  28.14 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  31.58 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.17 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  28.17 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  28.17 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  26.53 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  27.45 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  29.91 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  26.8 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  24.48 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  25.43 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  28.68 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  27.84 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  25.87 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.31 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  25.35 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  26.53 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  26.14 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  27.16 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  25.9 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  31.71 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  25.85 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  27.49 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  25.26 
 
 		 859 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.82 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25.77 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  28 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  23.81 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  26.72 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  24.85 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  24.85 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  24.85 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  24.85 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  24.85 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.85 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  24.85 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  26.53 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  27.18 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.3 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  26.17 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  27.98 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  26.74 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.58 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  24.26 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  26.04 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  19.76 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  24.66 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  22.86 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  29.2 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>