138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1658 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  46.43 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  45.56 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  41.28 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  41.04 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  33.99 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  30 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.37 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  35.17 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.55 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  33.97 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  27.04 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  32.12 
 
 		 859 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  33.33 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.84 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  33.08 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  33.08 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  33.08 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.6 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.45 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.45 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  30.51 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.55 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  29.67 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  29.23 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.83 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  26.74 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.52 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  27.59 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  27.59 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  27.59 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.61 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  31.85 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.76 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.83 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  26.01 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  29.23 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  31.31 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  32.17 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.4 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  27.08 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  29.59 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.13 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  26.79 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.93 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.61 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.71 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  31.19 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  25.93 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.92 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  30.61 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  26.92 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.61 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  29.06 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  24.44 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  26.56 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  26.67 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  27.42 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.18 
 
 		 283 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.42 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.21 
 
 		 146 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  27.42 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  27.42 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 		 229 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  24.32 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>