52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1630 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  100 
 
 
350 aa  697    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  41.64 
 
 
348 aa  232  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  40.58 
 
 
352 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  41.43 
 
 
370 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  38.05 
 
 
350 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  38.78 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  40.36 
 
 
350 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  38.81 
 
 
351 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  36.96 
 
 
363 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  37.39 
 
 
371 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  38.48 
 
 
357 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  36.78 
 
 
372 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  36.75 
 
 
356 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  35.93 
 
 
383 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  36.44 
 
 
387 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  35.06 
 
 
387 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  30.61 
 
 
351 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  28.74 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  28.41 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  27.7 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  31.48 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  24.42 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  26.44 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  25.24 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  32.35 
 
 
473 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  32.82 
 
 
392 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  32.82 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  32.82 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  32.82 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  32.82 
 
 
435 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  32.82 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  27.89 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  27.89 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  27.89 
 
 
357 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  29 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  27.81 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  27.37 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  27.37 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  27.37 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  24.42 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1385  hypothetical protein  22.4 
 
 
328 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0431733  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  27.44 
 
 
357 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  27.44 
 
 
357 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16030  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  26.06 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109512  hitchhiker  0.000000313895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3838  acyltransferase 3  24.53 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0999  acyltransferase 3  21.17 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1850  acyltransferase 3  32.38 
 
 
371 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.889698  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  20.3 
 
 
361 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  24.11 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  24.11 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  24.3 
 
 
431 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  24.11 
 
 
331 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>