22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1616 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 75 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  73.33 
 
 		 83 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  73.33 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  69.33 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  50 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  54.79 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.39 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  50 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  51.39 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  47.89 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  44.44 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7187  hypothetical protein  38.89 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000770139  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  41.89 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.48 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0194  toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  39.19 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2403  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.18 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10640  hypothetical protein  30.14 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1238  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.937532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  38.1 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>