More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1610 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  100 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  37.3 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  36.81 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  32.16 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.53 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  29.57 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  29.57 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  29.03 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.47 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  30.99 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.72 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  32.04 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  30.16 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  38.89 
 
 		 197 aa  84.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  32.54 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.65 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  27.78 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  32.76 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  32.56 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  34.03 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  34.72 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  31.61 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.33 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  32.18 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  32.72 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  31.61 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  30.36 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  29.38 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.11 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.11 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  31.03 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  31.03 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.9 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  32.95 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  32.61 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.07 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  31.03 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.37 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  32.95 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  33.95 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  34.73 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  34.73 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  37.6 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  32.1 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  27.96 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  32.26 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  32.1 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  32.1 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  32.62 
 
 		 441 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.2 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  34.29 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  32.94 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.94 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.92 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.94 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  33.78 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  29.12 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  32.06 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  29.57 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  30.46 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  26.4 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.53 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  33.33 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  31.18 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  27.37 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  31.25 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  28.92 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  31.25 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  33.93 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  28.49 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  31.1 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  32.35 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  32.76 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  32.35 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30.63 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  29.32 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  28.25 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  27.93 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.87 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  31.21 
 
 		 420 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  32.87 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  32.87 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  31.46 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.87 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.87 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.87 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  32.87 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  29.89 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.11 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  30.43 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6481  cytochrome B561  32.39 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156501  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6716  cytochrome B561  32.39 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.405595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  28.92 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  32.14 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  27.12 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  36.88 
 
 		 416 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  31.89 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  31.89 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  27.01 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>