More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1602 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  69 
 
 		 463 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  68.5 
 
 		 467 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  67.25 
 
 		 493 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  67.4 
 
 		 466 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  67.84 
 
 		 466 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  70.04 
 
 		 465 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  67.18 
 
 		 466 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 460 aa  934    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  67.84 
 
 		 467 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  68.12 
 
 		 488 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  67.62 
 
 		 467 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  69.43 
 
 		 465 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  70.09 
 
 		 465 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  69.93 
 
 		 463 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  71.81 
 
 		 466 aa  642    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  68.27 
 
 		 473 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  70.59 
 
 		 463 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  72.98 
 
 		 459 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  70.59 
 
 		 462 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  70.59 
 
 		 463 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  71.4 
 
 		 462 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  69.96 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  67.9 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  67.9 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  68.34 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  68.56 
 
 		 465 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  68.78 
 
 		 465 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  69.32 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  67.18 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  71.46 
 
 		 462 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  65.72 
 
 		 463 aa  614  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 		 471 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  65.72 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  64.18 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  67.25 
 
 		 463 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  62.88 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  62.2 
 
 		 458 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  62.31 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  62.23 
 
 		 469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  55.43 
 
 		 471 aa  555  1e-157  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  56.29 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  55.8 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  54.95 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  56.02 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  55.02 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  53.79 
 
 		 461 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  55.38 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  54.19 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  54.8 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  54.8 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  54.67 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  55.96 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  54.29 
 
 		 476 aa  495  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  54.29 
 
 		 469 aa  494  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  54.19 
 
 		 457 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  54.59 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  53.76 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  53.51 
 
 		 491 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  53.64 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  53.54 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  52.52 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  55.96 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  55.23 
 
 		 462 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 		 460 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  54.36 
 
 		 460 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  51.98 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52.86 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  49.02 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  53.78 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  52.72 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  52.07 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  52.72 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  52.51 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 		 478 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  53.61 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  52.72 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  53.83 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  52.07 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  51.32 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  52.94 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  52.05 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  53.93 
 
 		 459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  50.89 
 
 		 461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  52.24 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  52.46 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  55.35 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>