55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1593 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  47.83 
 
 
300 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  43.56 
 
 
238 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  42.27 
 
 
238 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  42.86 
 
 
232 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  44.97 
 
 
241 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  42.56 
 
 
246 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  45.03 
 
 
241 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  42.35 
 
 
218 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  45.36 
 
 
245 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  44.38 
 
 
302 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  47.24 
 
 
238 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  40.54 
 
 
207 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  45 
 
 
241 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  42.19 
 
 
234 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  44.69 
 
 
240 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  45.96 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  40.7 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  40.7 
 
 
300 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  41.67 
 
 
283 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  41.85 
 
 
221 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  43.59 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  43.43 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  45.7 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  36.99 
 
 
202 aa  121  9e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  40.97 
 
 
226 aa  121  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  37.99 
 
 
195 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  40.46 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  39.29 
 
 
177 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  35.93 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  46.67 
 
 
176 aa  94.7  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  38.78 
 
 
198 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  38.41 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  36.3 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  38.36 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  37.67 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  35.62 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  35.62 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  34.97 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  28.04 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.84 
 
 
264 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  33.96 
 
 
206 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  30.53 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  29.76 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.73 
 
 
262 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  29.11 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  22.54 
 
 
263 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  26.67 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  28.95 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  33.67 
 
 
199 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  29.03 
 
 
193 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  31.96 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  29.1 
 
 
188 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  31.62 
 
 
252 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>