More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1578 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
256 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  57.71 
 
 
256 aa  310  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.25 
 
 
256 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  56.86 
 
 
262 aa  308  5e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.03 
 
 
256 aa  308  6e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  59.38 
 
 
278 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  53.91 
 
 
256 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.03 
 
 
256 aa  294  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  56.52 
 
 
255 aa  292  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.73 
 
 
254 aa  291  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.91 
 
 
260 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  55.91 
 
 
257 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  61.42 
 
 
248 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.4 
 
 
255 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.3 
 
 
260 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.42 
 
 
256 aa  283  1e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.6 
 
 
255 aa  283  2e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.42 
 
 
256 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.78 
 
 
255 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.2 
 
 
255 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.36 
 
 
255 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  50.8 
 
 
255 aa  270  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.57 
 
 
256 aa  266  3e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  50.8 
 
 
255 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  51.38 
 
 
255 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.99 
 
 
255 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.2 
 
 
255 aa  255  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  54.87 
 
 
227 aa  255  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.99 
 
 
256 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.63 
 
 
272 aa  252  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
256 aa  251  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  49.41 
 
 
256 aa  251  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.32 
 
 
246 aa  246  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 
242 aa  245  5e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.22 
 
 
282 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
255 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.45 
 
 
255 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.81 
 
 
271 aa  238  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.85 
 
 
259 aa  233  2e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
259 aa  231  8e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
259 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 
242 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
257 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.33 
 
 
257 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.49 
 
 
263 aa  221  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.48 
 
 
258 aa  219  4e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
257 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
248 aa  216  3e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.79 
 
 
257 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  46.48 
 
 
252 aa  214  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.96 
 
 
257 aa  214  1e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  44.79 
 
 
257 aa  213  3e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.64 
 
 
266 aa  213  3e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.62 
 
 
258 aa  212  6e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.21 
 
 
259 aa  212  6e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.87 
 
 
258 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  45 
 
 
259 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  45 
 
 
259 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.62 
 
 
259 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
257 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  46.27 
 
 
266 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.39 
 
 
264 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.53 
 
 
250 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  45.53 
 
 
250 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  45 
 
 
259 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  43.08 
 
 
259 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
257 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.02 
 
 
257 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.57 
 
 
256 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.28 
 
 
263 aa  201  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  45.76 
 
 
284 aa  201  1e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  45.74 
 
 
255 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.92 
 
 
258 aa  197  1e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.85 
 
 
273 aa  197  2e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.43e-05  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 
252 aa  197  2e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.22 
 
 
267 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
258 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 
267 aa  196  5e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  9.87439e-07  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.49 
 
 
279 aa  196  5e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  42.19 
 
 
252 aa  195  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.62 
 
 
279 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.08 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.52 
 
 
263 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  49.08 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.08 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.08 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.08 
 
 
268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.43 
 
 
268 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  1.56624e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.8 
 
 
251 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
250 aa  191  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.19 
 
 
252 aa  191  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.85 
 
 
273 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.39023e-06  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.69 
 
 
263 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.44 
 
 
269 aa  189  3e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.91 
 
 
257 aa  189  3e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.21 
 
 
273 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.75 
 
 
260 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.15 
 
 
258 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.21 
 
 
273 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 
265 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>