47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1527 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  100 
 
 		 171 aa  349  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  35 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  35.22 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  34.59 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  32.54 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  33.54 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  31.87 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  34.31 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  33.11 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  35.92 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  30.32 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  33.33 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  29.58 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  28.57 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  32.5 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  34.62 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  31.41 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  30.13 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  29.61 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  34.56 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  26.99 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  30.63 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  31.76 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  29.2 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  26.75 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  26.75 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  27.56 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  28.32 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  24.84 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1223  hypothetical protein  34.26 
 
 		 283 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.808212 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  28.47 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  24.18 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  29.41 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  25.19 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  23.7 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  24.44 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2079  hypothetical protein  27.14 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.488973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  24.44 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  30.89 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  22.22 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1367  hypothetical protein  27.07 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02059  hypothetical protein  27.73 
 
 		 136 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0309564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  24.44 
 
 		 159 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  27.03 
 
 		 275 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  22.22 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  22.22 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  25.17 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>