66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1511 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1886 aa  3667    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  27.7 
 
 		 1369 aa  97.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  31.91 
 
 		 763 aa  97.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.54 
 
 		 774 aa  87  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  26.22 
 
 		 1677 aa  80.1  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  27.92 
 
 		 1011 aa  78.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  28.23 
 
 		 1333 aa  77.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.3 
 
 		 1242 aa  74.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  26.67 
 
 		 1012 aa  72  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 		 939 aa  70.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  29.57 
 
 		 664 aa  68.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  29.25 
 
 		 816 aa  65.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  25.81 
 
 		 1782 aa  65.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  32 
 
 		 684 aa  64.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  33.84 
 
 		 924 aa  63.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.25 
 
 		 972 aa  63.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.32 
 
 		 641 aa  63.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  28.45 
 
 		 1222 aa  63.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.62 
 
 		 1179 aa  62  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  23.88 
 
 		 1068 aa  61.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 723 aa  61.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  27.02 
 
 		 1025 aa  60.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  23.57 
 
 		 998 aa  58.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  30.54 
 
 		 607 aa  58.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  25.48 
 
 		 985 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  29.76 
 
 		 684 aa  56.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  25.2 
 
 		 10429 aa  55.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.61 
 
 		 1673 aa  54.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  25.86 
 
 		 2407 aa  54.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0501  outer membrane autotransporter  22.99 
 
 		 1371 aa  54.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.419631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.09 
 
 		 1156 aa  54.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.7 
 
 		 1489 aa  54.3  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  24.37 
 
 		 728 aa  54.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  24.37 
 
 		 728 aa  53.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  24.37 
 
 		 728 aa  54.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  27.74 
 
 		 831 aa  53.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  29.32 
 
 		 1234 aa  52.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0478  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.15 
 
 		 2209 aa  52  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.87 
 
 		 629 aa  52  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  24.71 
 
 		 646 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  25.48 
 
 		 3506 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.36 
 
 		 1154 aa  48.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.89 
 
 		 1322 aa  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1780  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.23 
 
 		 2065 aa  48.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  23.49 
 
 		 814 aa  48.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.23 
 
 		 1028 aa  47.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  25.1 
 
 		 646 aa  48.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  25.64 
 
 		 994 aa  47.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  28.5 
 
 		 1078 aa  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  24.38 
 
 		 907 aa  47.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  25.4 
 
 		 677 aa  47.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.14 
 
 		 1251 aa  47  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  32.08 
 
 		 909 aa  47  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  32.08 
 
 		 965 aa  47.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  27.01 
 
 		 658 aa  47  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0259  Outer membrane autotransporter barrel  27.59 
 
 		 940 aa  47  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2659  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30 
 
 		 2407 aa  47  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  34.95 
 
 		 942 aa  46.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  38.71 
 
 		 1099 aa  46.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  33.98 
 
 		 647 aa  46.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  38.71 
 
 		 1093 aa  46.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  38.71 
 
 		 1093 aa  46.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  28.99 
 
 		 1458 aa  46.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  38.71 
 
 		 1115 aa  46.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  24.73 
 
 		 506 aa  46.2  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  24.73 
 
 		 506 aa  45.8  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>