More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1504 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  68.06 
 
 
913 aa  1265  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  67.91 
 
 
919 aa  1226  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  57.83 
 
 
917 aa  1048  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  58.95 
 
 
932 aa  1068  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  64.59 
 
 
936 aa  1130  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  58 
 
 
911 aa  1007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  57.14 
 
 
918 aa  1048  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  68.42 
 
 
911 aa  1266  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  68.31 
 
 
911 aa  1261  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  67.51 
 
 
916 aa  1192  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  68.09 
 
 
921 aa  1239  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  68.53 
 
 
911 aa  1265  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  61.98 
 
 
908 aa  1098  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  67.73 
 
 
913 aa  1261  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  67.42 
 
 
930 aa  1213  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  68.06 
 
 
913 aa  1264  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  71.08 
 
 
930 aa  1266  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  70.14 
 
 
927 aa  1251  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  68.86 
 
 
921 aa  1242  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  58.37 
 
 
904 aa  1019  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  66.45 
 
 
927 aa  1172  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  66.45 
 
 
901 aa  1187  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  57.87 
 
 
912 aa  1006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  55.3 
 
 
906 aa  987  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  68.78 
 
 
912 aa  1198  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  57.71 
 
 
912 aa  1008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  56.12 
 
 
901 aa  947  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  55.82 
 
 
916 aa  979  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  67.28 
 
 
922 aa  1224  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  100 
 
 
914 aa  1845  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  69.15 
 
 
924 aa  1237  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  70.61 
 
 
933 aa  1310  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  59.98 
 
 
915 aa  1063  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  53.66 
 
 
928 aa  944  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  55.19 
 
 
906 aa  983  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  68.09 
 
 
926 aa  1250  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  68.31 
 
 
911 aa  1261  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  73.03 
 
 
1079 aa  738  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  63.26 
 
 
942 aa  1115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  49.57 
 
 
942 aa  854  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  58.93 
 
 
909 aa  1040  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  66.81 
 
 
918 aa  1189  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  66.92 
 
 
936 aa  1217  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  73.03 
 
 
1071 aa  738  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  56.64 
 
 
901 aa  948  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  68.53 
 
 
911 aa  1266  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  73.03 
 
 
1089 aa  737  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  73.03 
 
 
1066 aa  737  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  67.8 
 
 
916 aa  1217  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  71.54 
 
 
929 aa  1280  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  67.95 
 
 
913 aa  1264  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  61.55 
 
 
994 aa  1141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  58.65 
 
 
943 aa  1081  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  62.92 
 
 
920 aa  1133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  57.87 
 
 
912 aa  1020  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  73.03 
 
 
1082 aa  738  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  57.67 
 
 
912 aa  992  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  54.98 
 
 
906 aa  959  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  56.75 
 
 
901 aa  951  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  64.25 
 
 
911 aa  1154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  67.06 
 
 
936 aa  1214  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.3 
 
 
914 aa  957  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  68.53 
 
 
911 aa  1267  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  73.03 
 
 
1071 aa  738  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  68.53 
 
 
911 aa  1267  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  68.53 
 
 
911 aa  1267  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  69.62 
 
 
925 aa  1257  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  70.95 
 
 
930 aa  1297  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  55.41 
 
 
906 aa  986  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.63 
 
 
907 aa  1004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  69.31 
 
 
927 aa  1249  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  68.53 
 
 
911 aa  1266  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  55.44 
 
 
935 aa  1016  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  73.43 
 
 
1017 aa  764  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  69.47 
 
 
922 aa  1281  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.33 
 
 
913 aa  949  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  40.94 
 
 
512 aa  365  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  39.02 
 
 
590 aa  365  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  39.51 
 
 
593 aa  360  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.35 
 
 
510 aa  360  9e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40.56 
 
 
593 aa  358  2e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  40.39 
 
 
578 aa  356  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 
541 aa  338  2e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  36.58 
 
 
582 aa  338  4e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 
576 aa  335  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
580 aa  335  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  35.93 
 
 
580 aa  335  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  36.31 
 
 
579 aa  334  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  38.06 
 
 
575 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  37.32 
 
 
588 aa  332  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 
579 aa  328  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  37.46 
 
 
587 aa  327  4e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41514e-05 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  33.19 
 
 
1106 aa  321  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 
578 aa  315  2e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  35.69 
 
 
578 aa  315  3e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 
578 aa  315  3e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  35.69 
 
 
578 aa  315  3e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  35.69 
 
 
578 aa  315  4e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.69 
 
 
578 aa  315  4e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  38.71 
 
 
578 aa  314  6e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>