More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1393 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  67.71 
 
 		 237 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  66.08 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  64.89 
 
 		 247 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  64.6 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  65.61 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  66.36 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  65.75 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  67.74 
 
 		 231 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  67.56 
 
 		 231 aa  284  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  65.04 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.55 
 
 		 235 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  66.37 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  63.23 
 
 		 227 aa  278  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  65.94 
 
 		 229 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  62.78 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  62.78 
 
 		 260 aa  275  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  62.04 
 
 		 217 aa  275  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  64.98 
 
 		 228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  65.07 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  68.49 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  65.79 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  60.83 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  64.63 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  62.44 
 
 		 233 aa  268  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  62.84 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  61.88 
 
 		 239 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  61.71 
 
 		 235 aa  264  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  60.81 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  62.33 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  60.73 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  65 
 
 		 202 aa  258  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  55.9 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  61.84 
 
 		 228 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  57.58 
 
 		 258 aa  248  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.1 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  53.81 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  55.51 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  57.02 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 		 237 aa  234  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  54.63 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  61.76 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  67.65 
 
 		 174 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  54.63 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  54.87 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  53.27 
 
 		 228 aa  232  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  54.42 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  55.07 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  54.63 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  53.85 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  55.2 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  54.59 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  54.59 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  54.21 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  50.93 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  56.16 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  51.1 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  57 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  53.42 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  52.53 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  54.42 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  53.02 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 253 aa  218  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  47.11 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.11 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  52.56 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  54.67 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  47.11 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  48.6 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  48.85 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48.44 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  54.42 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  49.77 
 
 		 237 aa  214  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0650  ABC transporter related  57.82 
 
 		 215 aa  214  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.861483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  50.23 
 
 		 243 aa  214  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  52.5 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  47.77 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  55.05 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  47.56 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  48.64 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  50.67 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  46.29 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>