257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1392 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  100 
 
 
226 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  62.3 
 
 
201 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  64.64 
 
 
204 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  54.37 
 
 
210 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  55.24 
 
 
216 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  54.03 
 
 
218 aa  221  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  46.44 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  53.4 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  60 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  54.76 
 
 
216 aa  218  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  54.77 
 
 
204 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  55.29 
 
 
240 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  55.72 
 
 
202 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  50.48 
 
 
214 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  52.5 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  52 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  58.16 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 
214 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  62.3 
 
 
257 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  54.87 
 
 
255 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  56.38 
 
 
211 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  50.47 
 
 
227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  56.35 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  53.72 
 
 
251 aa  196  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  49.75 
 
 
255 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  49.78 
 
 
240 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  55.68 
 
 
214 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  52.38 
 
 
198 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  54.17 
 
 
209 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  48.11 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  47.64 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  49.72 
 
 
223 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  47.14 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  50.28 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  48.73 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  45.93 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  47.37 
 
 
210 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  50 
 
 
233 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.6 
 
 
228 aa  164  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.97 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  45.81 
 
 
252 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  42.41 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.93 
 
 
270 aa  161  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  44.32 
 
 
266 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  45.3 
 
 
249 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  43.27 
 
 
234 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.33 
 
 
225 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.32 
 
 
237 aa  147  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 
222 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  42.19 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  40.3 
 
 
208 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  40.89 
 
 
223 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  43.27 
 
 
212 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  36.32 
 
 
195 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  40.74 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  37.75 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  40.98 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  40.57 
 
 
226 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  37.44 
 
 
188 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  42.21 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  38.24 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  41.67 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  38.54 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  38.04 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  37.62 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  38.33 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  41.27 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  42.08 
 
 
205 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  42.31 
 
 
216 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  35.89 
 
 
227 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  37.97 
 
 
201 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  38.5 
 
 
199 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  37.68 
 
 
224 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  37.97 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  39.44 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  36.46 
 
 
195 aa  124  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  36.9 
 
 
201 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  36.59 
 
 
201 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  36.1 
 
 
201 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  40.44 
 
 
190 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  34.91 
 
 
199 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  34.91 
 
 
199 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  34.91 
 
 
199 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  37.95 
 
 
202 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  38.38 
 
 
215 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  36.7 
 
 
219 aa  121  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  36.41 
 
 
209 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  38.33 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  37.78 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  38.92 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  37.88 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  39.78 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  35.18 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  37.02 
 
 
209 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  36.41 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  42.47 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  35.29 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  36.87 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  41.34 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  38.89 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>