237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1388 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1388  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  100 
 
 
104 aa  208  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0099  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  60.61 
 
 
101 aa  133  6e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3534  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  61.29 
 
 
125 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3922  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  60.87 
 
 
96 aa  129  1e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450705  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.16 
 
 
102 aa  129  1e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3258  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.12 
 
 
102 aa  128  2e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57.14 
 
 
102 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0458718  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2978  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57.14 
 
 
125 aa  127  4e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3338  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57 
 
 
137 aa  127  7e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0248  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  61.86 
 
 
99 aa  126  8e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.52 
 
 
102 aa  126  1e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2926  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56 
 
 
101 aa  125  1e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2809  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57.58 
 
 
101 aa  126  1e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.891802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0703  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  59.6 
 
 
101 aa  126  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0068  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.52 
 
 
102 aa  126  1e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4002  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56 
 
 
101 aa  125  1e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1617  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56 
 
 
130 aa  125  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0207  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56 
 
 
123 aa  125  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56 
 
 
130 aa  125  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0896385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2985  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56 
 
 
130 aa  125  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3384  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56 
 
 
130 aa  125  2e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0095  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.12 
 
 
102 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4648  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  70 
 
 
96 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3629  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.57 
 
 
101 aa  123  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.38 
 
 
119 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0010  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.35 
 
 
96 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  58.76 
 
 
101 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0438  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  61.86 
 
 
98 aa  120  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.25 
 
 
100 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0094  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  59.14 
 
 
96 aa  117  5e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0770  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.84 
 
 
95 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3226  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.84 
 
 
99 aa  113  1e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1825  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  57.95 
 
 
122 aa  112  1e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.309531  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1419  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.52 
 
 
97 aa  112  2e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_004310  BR0082  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.19 
 
 
97 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.406903  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0080  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.19 
 
 
97 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3550  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.52 
 
 
101 aa  111  4e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  52.53 
 
 
101 aa  110  4e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0057  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  62.2 
 
 
93 aa  109  1e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.80763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0134  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57.73 
 
 
97 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.96 
 
 
96 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3728  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  55.06 
 
 
101 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341659  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1118  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.35 
 
 
96 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4051  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.26 
 
 
101 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4174  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  55.43 
 
 
100 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3347  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.19 
 
 
98 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2045  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.83 
 
 
107 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0827962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2474  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.19 
 
 
98 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.791787  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0169  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.11 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11183  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  52.94 
 
 
94 aa  97.1  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3071  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0423  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  50.52 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0873701  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1468  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.19 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.87 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  50 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5415  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.81 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.236997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.25 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14356  predicted protein  60.66 
 
 
64 aa  89  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1008  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  57.35 
 
 
76 aa  88.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  49.49 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1824  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  54.55 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.749262  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  53.85 
 
 
92 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01754  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase protein  58.21 
 
 
100 aa  87.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.9371  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0254  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  55.41 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.569153 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04911  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  47.19 
 
 
96 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.449188  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05481  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  54.55 
 
 
101 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.713347  normal  0.538116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  53.33 
 
 
92 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1689  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.05 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1692  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  50 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2232  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  54.29 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0673  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  47.31 
 
 
96 aa  83.2  1e-15  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252201  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0706  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  54.41 
 
 
102 aa  82.8  2e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.51 
 
 
103 aa  79.7  1e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0994809 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0492  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.46 
 
 
96 aa  79.7  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.032217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.01 
 
 
99 aa  79.3  1e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3055  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.33 
 
 
83 aa  79.3  1e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05551  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.08 
 
 
96 aa  80.1  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.593929  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05181  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.45 
 
 
96 aa  79  2e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00643072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05471  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.45 
 
 
96 aa  79  2e-14  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.375908  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.22 
 
 
97 aa  77  8e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.33 
 
 
97 aa  76.6  1e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5000  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  51.52 
 
 
78 aa  72.4  2e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  7.18198e-05  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0700  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40 
 
 
96 aa  72  3e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000704537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.05 
 
 
94 aa  72  3e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0380  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.86 
 
 
96 aa  71.2  5e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3734  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.05 
 
 
97 aa  70.9  6e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0475  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  55 
 
 
88 aa  70.9  6e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.77 
 
 
105 aa  70.1  1e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.17 
 
 
94 aa  69.7  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1535  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.62 
 
 
94 aa  69.3  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  2.24149e-10  normal  0.214474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0006  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.71 
 
 
97 aa  67.4  6e-11  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3348  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.98 
 
 
112 aa  67.4  6e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.107615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1468  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.11 
 
 
106 aa  67  9e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279515  normal  0.673491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0401  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.67 
 
 
112 aa  66.2  1e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.685477  hitchhiker  0.00013147 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0631  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.59 
 
 
113 aa  66.6  1e-10  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00151713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0376  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.08 
 
 
103 aa  66.6  1e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2696  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.98 
 
 
112 aa  65.5  2e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.71 
 
 
93 aa  66.2  2e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.08 
 
 
96 aa  64.7  4e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1891  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.74 
 
 
116 aa  64.3  6e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0206929  normal  0.972327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>