44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1381 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  397  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  39.55 
 
 		 169 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  39.31 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  37.06 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  37.43 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  35.26 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  38.42 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  38 
 
 		 227 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  38.51 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  38 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  34.16 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  32.37 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  31.9 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  34.36 
 
 		 169 aa  101  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  36.78 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  30.25 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  30.72 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  33.77 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  38.22 
 
 		 162 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  37.65 
 
 		 175 aa  94.4  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  31.15 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  32.54 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  34.09 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  30.95 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  31.55 
 
 		 177 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  31.87 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  29.94 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  29.76 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  27.33 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  28.81 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  27.33 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  27.33 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  27.85 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  25.9 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  29.48 
 
 		 312 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  23.08 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  24.44 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>