163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1362 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 107 aa  223  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  71.58 
 
 		 95 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  65.31 
 
 		 101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  62.79 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  62.22 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.52 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  63.22 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  57.3 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  59.3 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  58.14 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  57.3 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  56.18 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  55.29 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  58.24 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  50.56 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.17 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  56.98 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.22 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  57.65 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  55.17 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  51.58 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  55.81 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  53.26 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  50 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  53.33 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  56.32 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.22 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  57.65 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  55.81 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  51.16 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  51.16 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 		 95 aa  97.1  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  50.57 
 
 		 102 aa  96.7  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  52.38 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  50.59 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  47.67 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  51.76 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  47.19 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  41.49 
 
 		 100 aa  88.2  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  45.16 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  44.57 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  44.09 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  42.39 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.57 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  47.06 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  45.98 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  43.96 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  43.82 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  44.71 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  43.53 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  43.18 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.22 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  47.95 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  42.35 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  48.31 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.7 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  41.11 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  48.39 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  38.14 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  41.46 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  38.27 
 
 		 338 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  35.71 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.74 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  34.07 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.42 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2194  excinuclease ABC subunit C  44.26 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  37.18 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  32.97 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.29 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.29 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  36.59 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.26 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>