More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1358 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  100 
 
 		 288 aa  583  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 778 aa  221  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 798 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 773 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 617 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  44.78 
 
 		 790 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 620 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 717 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 1138 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 		 911 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 		 600 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 		 1274 aa  198  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 769 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 		 769 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 627 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 774 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  37.97 
 
 		 1035 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 844 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 583 aa  195  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 		 770 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  40.3 
 
 		 513 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  45.06 
 
 		 783 aa  195  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 468 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  45.06 
 
 		 783 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 511 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 1055 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 775 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 704 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1296 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1276 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 456 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 772 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 523 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 		 970 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 763 aa  192  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.57 
 
 		 1260 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 513 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  37.59 
 
 		 1035 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 784 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  39.02 
 
 		 1410 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  41.2 
 
 		 774 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.52 
 
 		 606 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  40.61 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 779 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 775 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 512 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  39.85 
 
 		 513 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 1192 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  39.85 
 
 		 513 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 607 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 587 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 605 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 		 646 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  43.98 
 
 		 648 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 769 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  42.74 
 
 		 771 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  40.7 
 
 		 470 aa  186  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 782 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 643 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  44.44 
 
 		 508 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 764 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 1046 aa  185  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  37.02 
 
 		 732 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 605 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 575 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 927 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 1352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 975 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  42.74 
 
 		 771 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 974 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 1022 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 568 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 494 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  40.42 
 
 		 773 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  40.71 
 
 		 548 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 573 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 531 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 765 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 		 687 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 610 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 502 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 513 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 765 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 614 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  42.68 
 
 		 532 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 		 661 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1433 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 969 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  39.92 
 
 		 511 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  40.87 
 
 		 565 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 631 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 		 940 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  39.77 
 
 		 503 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 697 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 395 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 1927 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 836 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>