55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1321 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  100 
 
 
629 aa  1273    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  39.18 
 
 
584 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  41.22 
 
 
614 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  38.98 
 
 
592 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  39.18 
 
 
571 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  40.72 
 
 
610 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  37.41 
 
 
628 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  39.01 
 
 
584 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  39.89 
 
 
584 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  38.12 
 
 
584 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  38.45 
 
 
568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  37.26 
 
 
569 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  37.29 
 
 
581 aa  330  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  36.97 
 
 
518 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  38.82 
 
 
573 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  37.99 
 
 
580 aa  312  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  39.35 
 
 
573 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  37.23 
 
 
617 aa  309  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  37.23 
 
 
543 aa  309  9e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  38.45 
 
 
524 aa  296  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  38.66 
 
 
570 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  38.48 
 
 
570 aa  293  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  36.25 
 
 
568 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  38.07 
 
 
570 aa  290  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  35.47 
 
 
548 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  33.63 
 
 
569 aa  280  7e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  34.91 
 
 
548 aa  277  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  37.36 
 
 
582 aa  269  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  34.01 
 
 
592 aa  257  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  34.33 
 
 
597 aa  253  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  33.77 
 
 
575 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  32.81 
 
 
584 aa  234  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  32.47 
 
 
581 aa  226  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  33.76 
 
 
596 aa  220  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  32.14 
 
 
572 aa  200  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  29.54 
 
 
628 aa  193  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  31.88 
 
 
567 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  31.69 
 
 
567 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  32.01 
 
 
565 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  29.57 
 
 
549 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  27.1 
 
 
547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  26.46 
 
 
561 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  27.11 
 
 
557 aa  97.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  27.36 
 
 
550 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  23.58 
 
 
541 aa  95.1  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  26.29 
 
 
587 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  27.66 
 
 
680 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  20.96 
 
 
603 aa  74.3  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  20.88 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  20.88 
 
 
651 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  32.26 
 
 
617 aa  70.5  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  32.75 
 
 
594 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  23.43 
 
 
545 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  24.62 
 
 
528 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  24.56 
 
 
600 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>