More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1312 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  100 
 
 		 302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  57.73 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  57.19 
 
 		 306 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  55.52 
 
 		 302 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  55.52 
 
 		 302 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  55.14 
 
 		 306 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  54.79 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  57.86 
 
 		 305 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  56.25 
 
 		 317 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  55.56 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  54.7 
 
 		 320 aa  311  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  55.48 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  55.48 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  55.48 
 
 		 302 aa  305  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  58.82 
 
 		 326 aa  305  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  55.67 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  55.15 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  54.03 
 
 		 315 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  55.37 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  52.94 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  52.58 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  54.86 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  50.66 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  50.52 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  52.08 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  52.08 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  50.34 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  52.08 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  52.74 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  54.55 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  52.33 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  51.03 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  48.8 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  49.32 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  49.48 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  49.83 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  47.16 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  43.31 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  42.61 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  42.61 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  42.41 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  39.53 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.44 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  38.03 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  40.14 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  43.45 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  39.79 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  38.6 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  38.25 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  38.93 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.6 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.6 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  39.51 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  34.04 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  38.6 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.89 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  38.25 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  38.25 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.25 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.89 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.14 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.14 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  37.72 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  39.45 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  40.28 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.92 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.36 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  37.72 
 
 		 918 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  34.21 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  36.21 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.71 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.09 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  36.42 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  36.09 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  35.29 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.04 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  36.75 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  35.83 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  34.48 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  34.6 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  35.1 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  33.68 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  36.56 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.63 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  34.17 
 
 		 290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  37.37 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  31.51 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.42 
 
 		 286 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  33.57 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  33.57 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  30.31 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  35.05 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  35.42 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.49 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  41.28 
 
 		 235 aa  146  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  36.19 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  34.81 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  34.74 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  28.97 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  33.79 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>