56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1299 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.77 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.45 
 
 
332 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.77 
 
 
302 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.53 
 
 
227 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.76 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.15 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.78 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.87 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.12 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  36.7 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.06 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.44 
 
 
315 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.44 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  39.29 
 
 
212 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.29 
 
 
212 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  41.46 
 
 
220 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.69 
 
 
212 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.13 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.15 
 
 
258 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.51 
 
 
315 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  34.26 
 
 
230 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  39.39 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.54 
 
 
222 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.81 
 
 
230 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  34.1 
 
 
258 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.9 
 
 
222 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.74 
 
 
206 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.84 
 
 
198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.91 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.5 
 
 
280 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.29 
 
 
212 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.51 
 
 
313 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 
312 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.43 
 
 
221 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  34.81 
 
 
210 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  36.59 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.71 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.59 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.49 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.67 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  23.58 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  23.29 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.2 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.55 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.12 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.03 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2459  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.15 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00395649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.12 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  31.82 
 
 
202 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  23.12 
 
 
171 aa  43.5  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  31.06 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  25.58 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  27.56 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.97 
 
 
210 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>