More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1294 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  58.74 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  58.74 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  57.14 
 
 		 268 aa  331  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  59.63 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  57.09 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  58.65 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  58.09 
 
 		 269 aa  321  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  56.99 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  56.99 
 
 		 269 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  56.55 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.51 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  56.99 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  56.83 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  55.88 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  57.2 
 
 		 352 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  56.98 
 
 		 267 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  55.39 
 
 		 267 aa  314  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  57.36 
 
 		 267 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  56.67 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  56.25 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  56.25 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  55.15 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  55.15 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  54.41 
 
 		 269 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  52.77 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  51.84 
 
 		 270 aa  291  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  54.1 
 
 		 262 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  53.73 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  56.11 
 
 		 270 aa  278  6e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  51.88 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  51.33 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  50.19 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  50.75 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  51.87 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  51.49 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  51.49 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  51.87 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  48.71 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  52.07 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  34.2 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  35.93 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  35.32 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.83 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  34.2 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  38.97 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  34.77 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.46 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  39.41 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  35.14 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  35.27 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  39.55 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  34.66 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  34.31 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  34.94 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  38.04 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  35.4 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  34.59 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.96 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  34.93 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  34.06 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  31.16 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  35.07 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  37.22 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  38.2 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.06 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  34.07 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  34.87 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  33.57 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  33.59 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  36.84 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  33.94 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  33.94 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  32.48 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  33.57 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  34.07 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  31.62 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  32.83 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  37.69 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  37.92 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  37.92 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  34.07 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  30.63 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  32 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  35.9 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  33.21 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  32 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  32.57 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  34.77 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  34.89 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>