273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1291 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 164 aa  319  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  35.95 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  37.32 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  40.56 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  31.76 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.8 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  33.54 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  32.45 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  35.21 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  36.36 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  32.89 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  33.1 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  33.11 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  32.45 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  33.8 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  29.69 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.15 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  32.28 
 
 		 210 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.62 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  31.5 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.17 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  34.75 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  34.23 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  32.28 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  34.23 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  30.71 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  30.71 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  30.71 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  29.8 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  32.28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.68 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  30.16 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  32.28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  32.28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  32.28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  30.16 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  32.28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  32.28 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  30.16 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  31.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  31.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  31.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  31.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  31.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  36.11 
 
 		 1043 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  30.95 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  31.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  30.95 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  32.73 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  32.73 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  30.71 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.59 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  30.71 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  30.71 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  31.82 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.32 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  32.2 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  32.43 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  29.92 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  29.37 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.22 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.77 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.16 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.67 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>