More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1289 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  70.13 
 
 		 256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  71.05 
 
 		 228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  70.93 
 
 		 228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  71.24 
 
 		 227 aa  335  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  71.81 
 
 		 228 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 228 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  71.81 
 
 		 228 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  69.2 
 
 		 227 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  69.2 
 
 		 227 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  71.24 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.18 
 
 		 228 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  69.2 
 
 		 227 aa  332  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3128  two component transcriptional regulator  70.93 
 
 		 228 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  hitchhiker  0.000183133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  70.18 
 
 		 228 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0280  two component transcriptional regulator  69.74 
 
 		 228 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5036  two component transcriptional regulator  73.58 
 
 		 232 aa  329  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3424  two component transcriptional regulator  69.64 
 
 		 227 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3763  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.54 
 
 		 227 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  68.28 
 
 		 228 aa  325  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  66.96 
 
 		 228 aa  324  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4088  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.64 
 
 		 227 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 228 aa  322  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 228 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.04 
 
 		 228 aa  318  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  63.16 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  64.35 
 
 		 228 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0177  two component transcriptional regulator  69.3 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0094  two component transcriptional regulator  69.74 
 
 		 228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  61.84 
 
 		 228 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.72 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  61.11 
 
 		 235 aa  297  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.28 
 
 		 228 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.28 
 
 		 228 aa  295  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.74 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  56.28 
 
 		 240 aa  275  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0059  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 228 aa  259  4e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3638  two component transcriptional regulator  46.81 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.91 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.17 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40.17 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  40.17 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  40.17 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  40.17 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40.17 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  40.17 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  40.17 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  38.08 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0898  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  39.65 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  39.22 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.63 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.96 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.59 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.1 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.55 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 652 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  37.66 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.2 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  38.46 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 250 aa  134  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  34.68 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  39.21 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  36.96 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  35.29 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>