53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1286 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  58.67 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.76 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  55.15 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  54.43 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  55.33 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  55.7 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  52.86 
 
 		 170 aa  147  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  53.49 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.85 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  48.47 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  47.7 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  43.03 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  43.86 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  46.45 
 
 		 171 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  45.91 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  44.77 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  48.68 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  43.03 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  45.56 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  46.11 
 
 		 204 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  49.13 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  45.34 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  45.96 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  45.96 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  45.89 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  40.83 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  40.7 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  41.25 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  40.59 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.88 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  36.41 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  44.87 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  44.68 
 
 		 164 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  40.65 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  40.65 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  37.97 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  95.9  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  38.96 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  35.68 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  33.99 
 
 		 503 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  33.99 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  34.11 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  28.87 
 
 		 530 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  33.1 
 
 		 358 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.35 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  28.66 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  32.41 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  30.32 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  30.72 
 
 		 295 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1222  S-layer domain protein  33.01 
 
 		 108 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  29.71 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  27.15 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>