163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1270 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  51.58 
 
 		 676 aa  671    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  51.91 
 
 		 680 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  52.45 
 
 		 682 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1375    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  52.4 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2586  protein of unknown function DUF255  51.03 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  48.54 
 
 		 687 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  45.75 
 
 		 676 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  45.93 
 
 		 676 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  45.56 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  45.27 
 
 		 666 aa  525  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  41.73 
 
 		 681 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  41.69 
 
 		 690 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2409  hypothetical protein  48.32 
 
 		 743 aa  498  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  43.31 
 
 		 685 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  41.51 
 
 		 699 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  40.03 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  43 
 
 		 666 aa  488  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  40.32 
 
 		 684 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  38.26 
 
 		 686 aa  489  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  39.09 
 
 		 680 aa  482  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  43.6 
 
 		 700 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  41.74 
 
 		 673 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  40.74 
 
 		 680 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  40 
 
 		 700 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  38.12 
 
 		 681 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  37.11 
 
 		 675 aa  473  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  42.25 
 
 		 681 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  37.19 
 
 		 703 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  38.11 
 
 		 686 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  42.46 
 
 		 679 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  42.2 
 
 		 662 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  42.3 
 
 		 696 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  42.03 
 
 		 694 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  41.07 
 
 		 699 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  40.22 
 
 		 752 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  37.3 
 
 		 671 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  37.87 
 
 		 686 aa  462  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  42.48 
 
 		 667 aa  458  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  42.77 
 
 		 665 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  40.56 
 
 		 714 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  39.43 
 
 		 707 aa  453  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  41.8 
 
 		 697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  41.31 
 
 		 676 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  37.1 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  41.3 
 
 		 665 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  38.67 
 
 		 700 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  41.87 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  42.18 
 
 		 658 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  40.5 
 
 		 725 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  41.17 
 
 		 672 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  39.71 
 
 		 678 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  38.27 
 
 		 673 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  39.94 
 
 		 721 aa  435  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  42.17 
 
 		 677 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  37.96 
 
 		 705 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  38.96 
 
 		 700 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  37.94 
 
 		 733 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  38.42 
 
 		 722 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  36.69 
 
 		 711 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  40.5 
 
 		 718 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  38.79 
 
 		 693 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  38.44 
 
 		 670 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  38.85 
 
 		 706 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  38.97 
 
 		 710 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  37.1 
 
 		 706 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  37.86 
 
 		 746 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  41.64 
 
 		 664 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  41.64 
 
 		 664 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  34.3 
 
 		 687 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  37.09 
 
 		 750 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  34.02 
 
 		 681 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  41.64 
 
 		 664 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  38.95 
 
 		 669 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  41.14 
 
 		 718 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  41 
 
 		 718 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  36.44 
 
 		 712 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  39.48 
 
 		 677 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  37.75 
 
 		 717 aa  404  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  38.36 
 
 		 699 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  37.95 
 
 		 660 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  36.27 
 
 		 720 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  40.06 
 
 		 673 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  36.59 
 
 		 723 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  39.62 
 
 		 656 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  34.4 
 
 		 688 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  35.34 
 
 		 669 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  39.34 
 
 		 652 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  34.26 
 
 		 688 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  39.17 
 
 		 696 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  36.13 
 
 		 720 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  39.74 
 
 		 657 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  36.84 
 
 		 756 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  37.82 
 
 		 751 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  34.93 
 
 		 687 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  39.32 
 
 		 665 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  37.3 
 
 		 699 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  36.61 
 
 		 737 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  39.6 
 
 		 711 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  34.3 
 
 		 700 aa  388  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>