143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1262 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 319 aa  633  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  48.7 
 
 		 317 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  49.83 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  45.91 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  48.8 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  44.48 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  45.93 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  47.31 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  45.37 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  46.08 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  44.73 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  45.51 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  40.78 
 
 		 316 aa  232  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  40.67 
 
 		 424 aa  228  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  37.58 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  41.33 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  36.81 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  32.51 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  37.94 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  34.48 
 
 		 474 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.63 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.63 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  28.25 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  27.5 
 
 		 339 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  29.36 
 
 		 442 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  27.39 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  27.94 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  30.45 
 
 		 580 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  26.88 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  33.83 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  27.71 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  27.1 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  27.1 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  30.4 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  27.04 
 
 		 436 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  30.22 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  29.02 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  31.43 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  31.43 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  29.84 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  29.93 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  31.42 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  30.95 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  31.33 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  29.46 
 
 		 512 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  30.29 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  28.72 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  29.07 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  25.99 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  29.7 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  26.64 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  27.02 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  28.06 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  27.31 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02988  hypothetical protein  28.83 
 
 		 112 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  27.86 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  32.94 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  22.47 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.63 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  26.72 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  26.72 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  26.72 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  26.72 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  26.72 
 
 		 460 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25.73 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  26.72 
 
 		 460 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  25.17 
 
 		 496 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  26.32 
 
 		 460 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  22.98 
 
 		 281 aa  52.8  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.45 
 
 		 518 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  25.9 
 
 		 460 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  28.57 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.5 
 
 		 477 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.6 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  32.53 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.27 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 273 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  25.1 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  28.84 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0501  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.2 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>