253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1239 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
182 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  80 
 
 
182 aa  293  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.34 
 
 
190 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.35 
 
 
186 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.33 
 
 
184 aa  291  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.78 
 
 
184 aa  288  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.97 
 
 
184 aa  287  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.22 
 
 
184 aa  287  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.22 
 
 
184 aa  286  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.86 
 
 
187 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.44 
 
 
176 aa  278  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.11 
 
 
193 aa  278  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.34 
 
 
189 aa  277  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.73 
 
 
186 aa  277  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.01 
 
 
176 aa  276  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.89 
 
 
187 aa  274  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.63 
 
 
206 aa  274  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.18 
 
 
186 aa  273  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.19 
 
 
175 aa  273  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.57 
 
 
193 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.71 
 
 
185 aa  272  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.29 
 
 
189 aa  270  9e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.11 
 
 
182 aa  269  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.91 
 
 
187 aa  268  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.43 
 
 
183 aa  267  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.27 
 
 
191 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  70 
 
 
199 aa  263  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.86 
 
 
186 aa  262  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.37 
 
 
197 aa  262  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.33 
 
 
175 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 
188 aa  253  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.43 
 
 
185 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.86 
 
 
185 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.93 
 
 
185 aa  247  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.33 
 
 
182 aa  246  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 
185 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.29 
 
 
184 aa  244  4e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 
182 aa  243  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.91 
 
 
182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
185 aa  240  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.12 
 
 
184 aa  240  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.87 
 
 
189 aa  240  7e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.48 
 
 
204 aa  239  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.78 
 
 
189 aa  239  1e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.29 
 
 
185 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 
183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 
185 aa  237  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
188 aa  237  8e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.32 
 
 
176 aa  237  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 
187 aa  236  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.32 
 
 
188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.71 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.01 
 
 
181 aa  231  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 
174 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 
181 aa  229  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
177 aa  229  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 
176 aa  228  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 
183 aa  228  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.11 
 
 
194 aa  228  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.89 
 
 
181 aa  227  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 
174 aa  227  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
193 aa  226  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 
172 aa  225  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  60.8 
 
 
180 aa  224  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 
178 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
174 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 
178 aa  224  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.33 
 
 
174 aa  224  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.27 
 
 
184 aa  223  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 
185 aa  223  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 
172 aa  223  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
174 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 
178 aa  221  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
181 aa  221  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 
176 aa  220  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
182 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 
177 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 
176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 
176 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 
176 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 
176 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 
174 aa  217  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  62.79 
 
 
176 aa  217  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 
176 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
176 aa  217  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 
176 aa  217  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
178 aa  216  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 
176 aa  216  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
175 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>