243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1140 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
231 aa  465  1e-130  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.67 
 
 
265 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.53 
 
 
250 aa  147  1e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.84 
 
 
263 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.84 
 
 
263 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.53 
 
 
338 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  40.53 
 
 
338 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.39 
 
 
258 aa  139  5e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.39 
 
 
278 aa  138  8e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 
264 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.53 
 
 
1153 aa  136  3e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.39 
 
 
269 aa  136  3e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.95 
 
 
269 aa  134  1e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.87 
 
 
259 aa  133  2e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  37.89 
 
 
273 aa  132  4e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.98 
 
 
260 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
235 aa  125  8e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
243 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.65 
 
 
247 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.96 
 
 
232 aa  119  4e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.11 
 
 
258 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
233 aa  118  8e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
281 aa  113  2e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.43 
 
 
808 aa  112  7e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 
261 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 
261 aa  110  1e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
253 aa  111  1e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.02 
 
 
266 aa  110  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.48 
 
 
228 aa  109  4e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 
282 aa  109  4e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.77 
 
 
243 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
226 aa  104  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 
255 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
242 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.23 
 
 
242 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 
292 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.62 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.68 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.05 
 
 
285 aa  95.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.28 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.33 
 
 
285 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.58 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 
252 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 
837 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
245 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.61 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  31.17 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.99 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.03 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.03 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.03 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.03 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.49 
 
 
299 aa  89.4  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.03 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.04 
 
 
253 aa  89  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.04 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.04 
 
 
253 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
253 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  30.04 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.34 
 
 
271 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
251 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  28.81 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.64 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 
267 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.64 
 
 
253 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  32.9 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
328 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  30.28 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.17 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  30.98 
 
 
256 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 
287 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
328 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
251 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
261 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 
264 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 
264 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.49 
 
 
271 aa  84.7  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
298 aa  84.7  1e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  29.88 
 
 
245 aa  84.7  1e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.88 
 
 
231 aa  84  2e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.92 
 
 
283 aa  83.6  2e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 
246 aa  84  2e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 
277 aa  84  2e-15  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
246 aa  83.2  3e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>