More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1124 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  100 
 
 		 625 aa  1280    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  44.34 
 
 		 581 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  44.83 
 
 		 581 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  42.93 
 
 		 587 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  43.97 
 
 		 604 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  43.76 
 
 		 601 aa  435  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  41.59 
 
 		 585 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  43.35 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  39.37 
 
 		 563 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  41.83 
 
 		 650 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  39.46 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  35.14 
 
 		 601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  33.75 
 
 		 545 aa  273  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  33.76 
 
 		 584 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.47 
 
 		 575 aa  250  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.3 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  35.04 
 
 		 538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.59 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  32.56 
 
 		 536 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  32.56 
 
 		 536 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  32.56 
 
 		 536 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  32.06 
 
 		 537 aa  234  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  30.29 
 
 		 564 aa  230  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 541 aa  217  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 543 aa  209  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  32.37 
 
 		 539 aa  208  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  31.65 
 
 		 542 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  32.19 
 
 		 545 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  31.47 
 
 		 554 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  31.74 
 
 		 555 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  28.05 
 
 		 543 aa  203  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.82 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  30.82 
 
 		 557 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.91 
 
 		 556 aa  200  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  32.44 
 
 		 537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 554 aa  198  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 557 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.25 
 
 		 545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  31.61 
 
 		 555 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  29.42 
 
 		 624 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  30.31 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.98 
 
 		 574 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  30.31 
 
 		 547 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.84 
 
 		 552 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  30.97 
 
 		 547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 544 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.31 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  31.49 
 
 		 590 aa  187  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.23 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.59 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.34 
 
 		 560 aa  180  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  29.19 
 
 		 573 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 526 aa  179  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.43 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 569 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.42 
 
 		 532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  27.7 
 
 		 638 aa  174  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 556 aa  173  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 569 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 603 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.55 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.56 
 
 		 542 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.45 
 
 		 539 aa  171  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.92 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.07 
 
 		 553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  28.6 
 
 		 543 aa  168  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  28.12 
 
 		 618 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.47 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.55 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  26.87 
 
 		 577 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.04 
 
 		 522 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.57 
 
 		 589 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  30.24 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.7 
 
 		 541 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.29 
 
 		 573 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  27.32 
 
 		 626 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.47 
 
 		 549 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.85 
 
 		 576 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  26.79 
 
 		 505 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.64 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  27.11 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  27.04 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 564 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  26.84 
 
 		 597 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  25.66 
 
 		 580 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.4 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  25.89 
 
 		 616 aa  154  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  25.26 
 
 		 608 aa  154  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.49 
 
 		 569 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.4 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.45 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  28.81 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.14 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>