More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1063 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
266 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  60.23 
 
 
269 aa  335  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  54.34 
 
 
265 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  53.61 
 
 
266 aa  290  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.45 
 
 
266 aa  288  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  55.17 
 
 
268 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.58 
 
 
266 aa  285  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  51.14 
 
 
267 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  50.95 
 
 
266 aa  279  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
265 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 
264 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 
267 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  51.17 
 
 
261 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 
262 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
262 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  48.26 
 
 
260 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.92 
 
 
266 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  47.53 
 
 
260 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  47.53 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  47.53 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
287 aa  225  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.89 
 
 
267 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 
287 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
272 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
268 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 
278 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
273 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.12 
 
 
263 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
261 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
261 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
261 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
267 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
273 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
268 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
271 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.64 
 
 
260 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.88 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
264 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
269 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
263 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  35.45 
 
 
261 aa  159  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
287 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 
260 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
274 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
262 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
262 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
264 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
262 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
262 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
267 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.36 
 
 
260 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
263 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.98 
 
 
260 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
263 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
263 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  40.34 
 
 
262 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1610  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  39.91 
 
 
262 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 
267 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3470  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
255 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
267 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
265 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
259 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
259 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
266 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
262 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
262 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
264 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
261 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3098  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
272 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
273 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
263 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
261 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.72 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.69 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
268 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>